利用数据科学的方法来定义数据科学（在数据科学中使用）
利用数据科学的方法来定义数据科学（在数据科学中使用）安装我将一路介绍 C 和 C 编程的必要背景，以便初学者和高级用户都可以继续学习。这是许多数据科学家遇到的普遍情况。示例数据是 Anscombe 的四重奏 的第一组，如下表所示。这是一组人工构建的数据，当拟合直线时可以提供相同的结果，但是它们的曲线非常不同。数据文件是一个文本文件，其中的制表符用作列分隔符，前几行作为标题。该任务将仅使用第一组（即前两列）。C 语言是通用编程语言，是当今使用最广泛的语言之一（依据 TIOBE 指数 、 RedMonk 编程语言排名 、 编程语言流行度指数 和 GitHub Octoverse 状态 得来）。这是一种相当古老的语言（大约诞生在 1973 年），并且用它编写了许多成功的程序（例如 Linux 内核和 Git 仅是其中的两个例子）。它也是最接近计算机内部运行机制的语言之一，因为它直接用于操作内存。它是一种 编译语言 ；因此，源代码必须由 编译器
让我们使用 C99 和 C 11 完成常见的数据科学任务。-- Cristiano L. Fontana（作者）
虽然 Python 和 R 之类的语言在数据科学中越来越受欢迎，但是 C 和 C 对于高效的数据科学来说是一个不错的选择。在本文中，我们将使用 C99 和 C 11 编写一个程序，该程序使用 Anscombe 的四重奏 数据集，下面将对其进行解释。
我在一篇涉及 Python 和 GNU Octave 的文章中写了我不断学习编程语言的动机，值得大家回顾。这里所有的程序都需要在 命令行 上运行，而不是在 图形用户界面（GUI） 上运行。完整的示例可在 polyglot_fit 存储库 中找到。
编程任务你将在本系列中编写的程序：
- 从 csv 文件 中读取数据
- 用直线插值数据（即 f(x)=m ⋅ x q）
- 将结果绘制到图像文件
这是许多数据科学家遇到的普遍情况。示例数据是 Anscombe 的四重奏 的第一组，如下表所示。这是一组人工构建的数据，当拟合直线时可以提供相同的结果，但是它们的曲线非常不同。数据文件是一个文本文件，其中的制表符用作列分隔符，前几行作为标题。该任务将仅使用第一组（即前两列）。
C 语言是通用编程语言，是当今使用最广泛的语言之一（依据 TIOBE 指数 、 RedMonk 编程语言排名 、 编程语言流行度指数 和 GitHub Octoverse 状态 得来）。这是一种相当古老的语言（大约诞生在 1973 年），并且用它编写了许多成功的程序（例如 Linux 内核和 Git 仅是其中的两个例子）。它也是最接近计算机内部运行机制的语言之一，因为它直接用于操作内存。它是一种 编译语言 ；因此，源代码必须由 编译器 转换为 机器代码 。它的 标准库 很小，功能也不多，因此人们开发了其它库来提供缺少的功能。
我最常在 数字运算 中使用该语言，主要是因为其性能。我觉得使用起来很繁琐，因为它需要很多 样板代码 ，但是它在各种环境中都得到了很好的支持。C99 标准是最新版本，增加了一些漂亮的功能，并且得到了编译器的良好支持。
我将一路介绍 C 和 C 编程的必要背景，以便初学者和高级用户都可以继续学习。
安装
要使用 C99 进行开发，你需要一个编译器。我通常使用 Clang ，不过 GCC 是另一个有效的开源编译器。对于线性拟合，我选择使用 GNU 科学库 。对于绘图，我找不到任何明智的库，因此该程序依赖于外部程序： Gnuplot 。该示例还使用动态数据结构来存储数据，该结构在 伯克利软件分发版（BSD） 中定义。
在 Fedora 中安装很容易：
sudo dnf install clang gnuplot gsl gsl-devel
代码注释
在 C99 中， 注释 的格式是在行的开头放置 //，行的其它部分将被解释器丢弃。另外，/* 和 */ 之间的任何内容也将被丢弃。
// 这是一个注释，会被解释器忽略
/* 这也被忽略 */
必要的库
库由两部分组成：
- 头文件 ，其中包含函数说明
- 包含函数定义的源文件
头文件包含在源文件中，而库文件的源文件则 链接 到可执行文件。因此，此示例所需的头文件是：
// 输入/输出功能
#include <stdio.h>
// 标准库
#include <stdlib.h>
// 字符串操作功能
#include <string.h>
// BSD 队列
#include <sys/queue.h>
// GSL 科学功能
#include <gsl/gsl_fit.h>
#include <gsl/gsl_statistics_double.h>
主函数
在 C 语言中，程序必须位于称为主函数 main() 的特殊函数内：
int main(void) {
...
}
这与上一教程中介绍的 Python 不同，后者将运行在源文件中找到的所有代码。
定义变量
在 C 语言中，变量必须在使用前声明，并且必须与类型关联。每当你要使用变量时，都必须决定要在其中存储哪种数据。你也可以指定是否打算将变量用作常量值，这不是必需的，但是编译器可以从此信息中受益。 以下来自存储库中的 fitting_C99.c 程序 ：
const char *input_file_name = "anscombe.csv";
const char *delimiter = "\t";
const unsigned int skip_header = 3;
const unsigned int column_x = 0;
const unsigned int column_y = 1;
const char *output_file_name = "fit_C99.csv";
const unsigned int N = 100;
C 语言中的数组不是动态的，从某种意义上说，数组的长度必须事先确定（即，在编译之前）：
int data_array[1024];
由于你通常不知道文件中有多少个数据点，因此请使用 单链列表 。这是一个动态数据结构，可以无限增长。幸运的是，BSD 提供了链表 。这是一个示例定义：
struct data_point {
double x;
double y;
SLIST_ENTRY(data_point) entries;
};
SLIST_HEAD(data_list data_point) head = SLIST_HEAD_INITIALIZER(head);
SLIST_INIT(&head);
该示例定义了一个由结构化值组成的 data_point 列表，该结构化值同时包含 x 值和 y 值。语法相当复杂，但是很直观，详细描述它就会太冗长了。
打印输出
要在终端上打印，可以使用 printf() 函数，其功能类似于 Octave 的 printf() 函数（在第一篇文章中介绍）：
printf("#### Anscombe's first set with C99 ####\n");
printf() 函数不会在打印字符串的末尾自动添加换行符，因此你必须添加换行符。第一个参数是一个字符串，可以包含传递给函数的其他参数的格式信息，例如：
printf("Slope: %f\n" slope);
读取数据
现在来到了困难的部分……有一些用 C 语言解析 CSV 文件的库，但是似乎没有一个库足够稳定或流行到可以放入到 Fedora 软件包存储库中。我没有为本教程添加依赖项，而是决定自己编写此部分。同样，讨论这些细节太啰嗦了，所以我只会解释大致的思路。为了简洁起见，将忽略源代码中的某些行，但是你可以在存储库中找到完整的示例代码。
首先，打开输入文件：
FILE* input_file = fopen(input_file_name "r");
然后逐行读取文件，直到出现错误或文件结束：
while (!ferror(input_file) && !feof(input_file)) {
size_t buffer_size = 0;
char *buffer = NULL;
getline(&buffer &buffer_size input_file);
...
}
getline() 函数是 POSIX.1-2008 标准 新增的一个不错的函数。它可以读取文件中的整行，并负责分配必要的内存。然后使用 strtok() 函数将每一行分成 字元 (token)。遍历字元，选择所需的列：
char *token = strtok(buffer delimiter);
while (token != NULL)
{
double value;
sscanf(token "%lf" &value);
if (column == column_x) {
x = value;
} else if (column == column_y) {
y = value;
}
column = 1;
token = strtok(NULL delimiter);
}
最后，当选择了 x 和 y 值时，将新数据点插入链表中：
struct data_point *datum = malloc(sizeof(struct data_point));
datum->x = x;
datum->y = y;
SLIST_INSERT_HEAD(&head datum entries);
malloc() 函数为新数据点动态分配（保留）一些持久性内存。
拟合数据
GSL 线性拟合函数 gslfitlinear() 期望其输入为简单数组。因此，由于你将不知道要创建的数组的大小，因此必须手动分配它们的内存：
const size_t entries_number = row - skip_header - 1;
double *x = malloc(sizeof(double) * entries_number);
double *y = malloc(sizeof(double) * entries_number);
然后，遍历链表以将相关数据保存到数组：
SLIST_FOREACH(datum &head entries) {
const double current_x = datum->x;
const double current_y = datum->y;
x[i] = current_x;
y[i] = current_y;
i = 1;
}
现在你已经处理完了链表，请清理它。要总是释放已手动分配的内存，以防止 内存泄漏 。内存泄漏是糟糕的、糟糕的、糟糕的（重要的话说三遍）。每次内存没有释放时，花园侏儒都会找不到自己的头：
while (!SLIST_EMPTY(&head)) {
struct data_point *datum = SLIST_FIRST(&head);
SLIST_REMOVE_HEAD(&head entries);
free(datum);
}
终于，终于！你可以拟合你的数据了：
gsl_fit_linear(x 1 y 1 entries_number
&intercept &slope
&cov00 &cov01 &cov11 &chi_squared);
const double r_value = gsl_stats_correlation(x 1 y 1 entries_number);
printf("Slope: %f\n" slope);
printf("Intercept: %f\n" intercept);
printf("Correlation coefficient: %f\n" r_value);
绘图
你必须使用外部程序进行绘图。因此，将拟合数据保存到外部文件：
const double step_x = ((max_x 1) - (min_x - 1)) / N;
for (unsigned int i = 0; i < N; i = 1) {
const double current_x = (min_x - 1) step_x * i;
const double current_y = intercept slope * current_x;
fprintf(output_file "%f\t%f\n" current_x current_y);
}
用于绘制两个文件的 Gnuplot 命令是：
plot 'fit_C99.csv' using 1:2 with lines title 'Fit' 'anscombe.csv' using 1:2 with points pointtype 7 title 'Data'
结果
在运行程序之前，你必须编译它：
clang -std=c99 -I/usr/include/ fitting_C99.c -L/usr/lib/ -L/usr/lib64/ -lgsl -lgslcblas -o fitting_C99
这个命令告诉编译器使用 C99 标准、读取 fitting_C99.c 文件、加载 gsl 和 gslcblas 库、并将结果保存到 fitting_C99。命令行上的结果输出为：
#### Anscombe's first set with C99 ####
Slope: 0.500091
Intercept: 3.000091
Correlation coefficient: 0.816421
这是用 Gnuplot 生成的结果图像：
Plot and fit of the dataset obtained with C99
C 11 方式C 语言是一种通用编程语言，也是当今使用的最受欢迎的语言之一。它是作为 C 的继承人 创建的（诞生于 1983 年），重点是 面向对象程序设计（OOP） 。C 通常被视为 C 的超集，因此 C 程序应该能够使用 C 编译器进行编译。这并非完全正确，因为在某些极端情况下它们的行为有所不同。 根据我的经验，C 与 C 相比需要更少的样板代码，但是如果要进行面向对象开发，语法会更困难。C 11 标准是最新版本，增加了一些漂亮的功能，并且基本上得到了编译器的支持。
由于 C 在很大程度上与 C 兼容，因此我将仅强调两者之间的区别。我在本部分中没有涵盖的任何部分，则意味着它与 C 中的相同。
安装
这个 C 示例的依赖项与 C 示例相同。 在 Fedora 上，运行：
sudo dnf install clang gnuplot gsl gsl-devel
必要的库
库的工作方式与 C 语言相同，但是 include 指令略有不同：
#include <cstdlib>
#include <cstring>
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <string>
#include <vector>
#include <algorithm>
extern "C" {
#include <gsl/gsl_fit.h>
#include <gsl/gsl_statistics_double.h>
}
由于 GSL 库是用 C 编写的，因此你必须将这个特殊情况告知编译器。
定义变量
与 C 语言相比，C 支持更多的数据类型（类），例如，与其 C 语言版本相比，string 类型具有更多的功能。相应地更新变量的定义：
const std::string input_file_name("anscombe.csv");
对于字符串之类的结构化对象，你可以定义变量而无需使用 = 符号。
打印输出
你可以使用 printf() 函数，但是 cout 对象更惯用。使用运算符 << 来指示要使用 cout 打印的字符串（或对象）：
std::cout << "#### Anscombe's first set with C 11 ####" << std::endl;
...
std::cout << "Slope: " << slope << std::endl;
std::cout << "Intercept: " << intercept << std::endl;
std::cout << "Correlation coefficient: " << r_value << std::endl;
读取数据
该方案与以前相同。将打开文件并逐行读取文件，但语法不同：
std::ifstream input_file(input_file_name);
while (input_file.good()) {
std::string line;
getline(input_file line);
...
}
使用与 C99 示例相同的功能提取行字元。代替使用标准的 C 数组，而是使用两个 向量 。向量是 C 标准库 中对 C 数组的扩展，它允许动态管理内存而无需显式调用 malloc()：
std::vector<double> x;
std::vector<double> y;
// Adding an element to x and y:
x.emplace_back(value);
y.emplace_back(value);
拟合数据
要在 C 中拟合，你不必遍历列表，因为向量可以保证具有连续的内存。你可以将向量缓冲区的指针直接传递给拟合函数：
gsl_fit_linear(x.data() 1 y.data() 1 entries_number
&intercept &slope
&cov00 &cov01 &cov11 &chi_squared);
const double r_value = gsl_stats_correlation(x.data() 1 y.data() 1 entries_number);
std::cout << "Slope: " << slope << std::endl;
std::cout << "Intercept: " << intercept << std::endl;
std::cout << "Correlation coefficient: " << r_value << std::endl;
绘图
使用与以前相同的方法进行绘图。 写入文件：
const double step_x = ((max_x 1) - (min_x - 1)) / N;
for (unsigned int i = 0; i < N; i = 1) {
const double current_x = (min_x - 1) step_x * i;
const double current_y = intercept slope * current_x;
output_file << current_x << "\t" << current_y << std::endl;
}
output_file.close();
然后使用 Gnuplot 进行绘图。
结果
在运行程序之前，必须使用类似的命令对其进行编译：
clang -std=c 11 -I/usr/include/ fitting_Cpp11.cpp -L/usr/lib/ -L/usr/lib64/ -lgsl -lgslcblas -o fitting_Cpp11
命令行上的结果输出为：
#### Anscombe's first set with C 11 ####
Slope: 0.500091
Intercept: 3.00009
Correlation coefficient: 0.816421
这就是用 Gnuplot 生成的结果图像：
Plot and fit of the dataset obtained with C 11
结论本文提供了用 C99 和 C 11 编写的数据拟合和绘图任务的示例。由于 C 在很大程度上与 C 兼容，因此本文利用了它们的相似性来编写了第二个示例。在某些方面，C 更易于使用，因为它部分减轻了显式管理内存的负担。但是其语法更加复杂，因为它引入了为 OOP 编写类的可能性。但是，仍然可以用 C 使用 OOP 方法编写软件。由于 OOP 是一种编程风格，因此可以在任何语言中使用。在 C 中有一些很好的 OOP 示例，例如 GObject 和 Jansson 库。
对于数字运算，我更喜欢在 C99 中进行，因为它的语法更简单并且得到了广泛的支持。直到最近，C 11 还没有得到广泛的支持，我倾向于避免使用先前版本中的粗糙不足之处。对于更复杂的软件，C 可能是一个不错的选择。
你是否也将 C 或 C 用于数据科学？在评论中分享你的经验。
via: https://opensource.com/article/20/2/c-data-science
作者： Cristiano L. Fontana 选题： lujun9972 译者： wxy 校对： wxy
本文由 LCTT 原创编译， Linux中国 荣誉推出
点击“了解更多”可访问文内链接
