tcga数据库如何做差异分析（TCGA的检索技巧初步的Analysis）

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听过酸菜讲课的同学都知道，文章有五恒量和三变量。做一个疾病恒量都是基本固定的，区别就在于变量中的分子、药物和通路。那些做肿瘤研究的就非常Happy了，因为已经有了很多现成的数据库把分子机制都总结好了，直接拿来就行，TCGA就是其中翘楚。

从2006年由美国国家癌症研究所（NCI）和国家人类基因组研究所（NHGRI）联合启动，至今已收录了超过11000位患者、33种肿瘤及配对组织的高通量芯片或测序数据，包括10种罕见肿瘤，对肿瘤研究者来说可谓巨大宝库。

常见的应用比如：分析肿瘤中基因突变的情况，找到有研究价值的致癌突变；比对肿瘤和正常组织，寻找异常的基因重组现象；分析肿瘤中差异基因的表达，找到有研究价值的基因；分析基因变异情况与预后的关系，探索研究或临床价值；通过比较基因的表达关系，分析肿瘤中基因的调控网络……

虽然TCGA的官网只有检索和简单的分析（17年11月新增了Analysis功能），但仍有其他众多工具可以实现各种各样的研究需求。

更美好的是，现在TCGA的检索技巧、初步的Analysis、数据下载和拓展应用，都融和在一份89页的解螺旋单元课PPT里~

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拓展：利用R语言分析

如此细致精美的讲解，已经惊艳得让小编说都不会话了。听内测学员说，这些内容在别的地方收费还不菲，吓得我又吃了一鲸！

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