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基因芯片技术的主要步骤(基因芯片基础知识全解析)

基因芯片技术的主要步骤(基因芯片基础知识全解析)2.Illunima芯片1.Affymetrix芯片基因芯片,是固定在某种介质上(如玻璃或石英平面、微粒等)的一系列微小特征序列(通常为DNA探针)的集合,可被用于定性或定量检查样品内核酸分子的成分。首先,课程会从芯片原理到制备步骤,较为全面详细地介绍了Thermo Fisher Affymetrix(赛默飞昂飞)、Illunima(因美纳)和Agilent(安捷伦)三大生信平台表达谱芯片的特点、芯片制备、检测基本原理与步骤,以及常见的表达谱芯片。

酸菜老师讲过,挑、圈、联、靠四字诀,是架构起生信文章分析的四大标准模块。这其中,挑即表达差异,指的是从高通量数据分析得到差异分子列表的数据处理过程。

在高通量检测这个领域中,基因芯片是当仁不让的扛把子,是了解基因组结构和功能的绝佳利器。生物大数据之所以这么红火,就是因为有芯片为科研者提供了海量数据来做支撑,唯有如此,科研者们才能深挖数据得到有用的信息。

因而,在《生信体系课-上篇》的第一个段位中,对芯片数据的来源和下载的具体阐释,就成为了第一个知识模块。其中,第一课所讲解的就是芯片(特别是表达谱芯片)的基础知识。

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基因芯片,是固定在某种介质上(如玻璃或石英平面、微粒等)的一系列微小特征序列(通常为DNA探针)的集合,可被用于定性或定量检查样品内核酸分子的成分。

首先,课程会从芯片原理到制备步骤,较为全面详细地介绍了Thermo Fisher Affymetrix(赛默飞昂飞)、Illunima(因美纳)和Agilent(安捷伦)三大生信平台表达谱芯片的特点、芯片制备、检测基本原理与步骤,以及常见的表达谱芯片。

1.Affymetrix芯片

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2.Illunima芯片

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3.Agilent芯片

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同时,课程也会重点介绍每个公司几款最常见表达谱芯片的优缺点以及芯片和测序这两大技术所具备的特点,方便大家在后续实验或GEO数据挖掘过程中,根据芯片的特点和用途选择芯片以及根据研究材料、目的和性价比参考等,来选择最合适的测序方法。

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