肩袖损伤后脂肪浸润基因表达谱及关键通路的生物信息学分析(肩袖损伤后脂肪浸润基因表达谱及关键通路的生物信息学分析)
肩袖损伤后脂肪浸润基因表达谱及关键通路的生物信息学分析(肩袖损伤后脂肪浸润基因表达谱及关键通路的生物信息学分析)关键词: 肩袖损伤 脂肪浸润 差异基因 生信信息学 GEO数据库中国组织工程研究杂志出版内容重点:组织构建;骨细胞;软骨细胞;细胞培养;成纤维细胞;血管内皮细胞;骨质疏松;组织工程方法:通过GEO数据库获取GSE93661芯片筛选差异表达基因,采用GO、KEGG分析脂肪浸润的潜在机制。通过构建PPI网络获取枢纽基因,分析潜在致病靶点。结果与结论:共鉴定差异表达基因471个。GO和KEGG分析表明神经活性配体-受体相互作用、细胞黏附分子通路是肩袖损伤脂肪浸润的潜在机制。白三烯B4受体(LTB4R)作为PPI网络中的枢纽基因,可能是肩袖损伤脂肪浸润的关键靶标。提示:文章发现了肩袖损伤后脂肪浸润病理发展中潜在的关键基因和通路,为今后的治疗提供了参考方向。https://orcid.org/0000-0003-1261-6120(刘沛东)
文题释义:肩袖损伤后脂肪浸润:是肩袖修补术后失败的关键因素之一,其与再撕裂率和功能预后密切相关。脂肪浸润多发生在肩袖撕裂后1年内,萎缩的肌肉组织被脂肪组织替代,并向邻近组织侵袭,影响肌肉及肌腱的质量及力学特性。
基因本体分析(Gene ontology,GO):是通过对生物学的3个方面——细胞组分(cellular component)、分子功能(molecular function)、生物过程(biological process),将差异基因从功能、参与的生物途径及细胞中的定位进行了标准化描述,即对基因产物进行了简单注释。
背景:脂肪浸润是肩袖修补术后失败的关键因素,然而肩袖损伤后脂肪浸润的病理变化机制尚不清楚。
目的:旨在探索肩袖损伤后关键基因的表达差异,确定其功能和机制通路,为肩袖损伤脂肪浸润的病理变化机制提供理论依据。
方法:通过GEO数据库获取GSE93661芯片筛选差异表达基因,采用GO、KEGG分析脂肪浸润的潜在机制。通过构建PPI网络获取枢纽基因,分析潜在致病靶点。
结果与结论:共鉴定差异表达基因471个。GO和KEGG分析表明神经活性配体-受体相互作用、细胞黏附分子通路是肩袖损伤脂肪浸润的潜在机制。白三烯B4受体(LTB4R)作为PPI网络中的枢纽基因,可能是肩袖损伤脂肪浸润的关键靶标。提示:文章发现了肩袖损伤后脂肪浸润病理发展中潜在的关键基因和通路,为今后的治疗提供了参考方向。
https://orcid.org/0000-0003-1261-6120(刘沛东)
中国组织工程研究杂志出版内容重点:组织构建;骨细胞;软骨细胞;细胞培养;成纤维细胞;血管内皮细胞;骨质疏松;组织工程
关键词: 肩袖损伤 脂肪浸润 差异基因 生信信息学 GEO数据库
引用本文:刘沛东 冯江峰 徐文杰 许晓栋 杨自权. 肩袖损伤后脂肪浸润基因表达谱及关键通路的生物信息学分析[J]. 中国组织工程研究 2021 25(11): 1773-1778.
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