等温吸附模型各参数怎么计算（自动高通量生成原子吸附模型）
等温吸附模型各参数怎么计算（自动高通量生成原子吸附模型）原子吸附模型如何搭建图2 灰色的为表面原子；红色的为顶位位点； 蓝色的为桥位位点；绿色的为穴位位点1）顶位（Ontop）：表面原子正上方的位置;2）桥位（Bridge）：某一个表面原子与它第一近邻原子的中间位置;3）穴位（Hollow）：三个、四个或者更多表面原子的中心位置。
之前，我们为大家介绍了自动化、高通量随机掺杂模型的搭建《【建模干货】高通量生成不同浓度的取代掺杂结构》除了取代掺杂这种方式以外，还可以通过搭建表面、界面结构来设计高性能新材料。构建表面后会导致表面原子的不饱和配位，通常通过吸附一些基团来饱和表面原子，也就是需要搭建相应的吸附模型；在催化、电池材料等领域，经常会设计各式各样的吸附剂，也会搭建各种吸附模型。今天给大家介绍高通量吸附建模神器—MatCloud ，帮你解决吸附建模的一切问题。
图1 吸附模型示意图
吸附位点
常见的有三种吸附位点:顶位、桥位和穴位。每一种吸附位点又可能包括多个不同的位置。
1）顶位（Ontop）：表面原子正上方的位置;
2）桥位（Bridge）：某一个表面原子与它第一近邻原子的中间位置;
3）穴位（Hollow）：三个、四个或者更多表面原子的中心位置。
图2 灰色的为表面原子；红色的为顶位位点； 蓝色的为桥位位点；绿色的为穴位位点
原子吸附模型如何搭建
1.依据结构表面原子的周期性，存在着多个吸附位点，如何快速搭建包含所有吸附位点的模型？
2.所有吸附模型中如何筛选并去除这些等价结构？
3.如何在不等价的结构中筛选出最稳定或者是性能最优的结构？
4.如何创建一定吸附浓度范围内的高通量吸附模型？
吸附建模同取代建模一样让人无从下手……
MatCloud 不需要下载及安装任何软件，通过云端操作，简单参数设置，即可完成高通量吸附模型的构建。
MatCloud 能够智能识别结构中的表面原子，依据表面原子的周期性自动寻找所有可能的吸附位点，高通量生成所有可能的吸附模型，且支持根据对称性去除等价结构。
图3 MatCloud 所有吸附位点的生成
接下来，我们以Mo2C吸附锂离子为例，说明MatCloud 平台如何高通量得到吸附模型MatCloud 高通量吸附建模实例
- 原模型：Mo2C表面结构
- 吸附原子：Li
- 吸附个数：1
- 吸附表面：上表面
- 吸附高度：2 Å
1.上传结构
MatCloud 平台支持cif、POSCAR、mol、pdb等多种格式文件。
图4 MatCloud 上传结构
2.创建高通量吸附建模工作流
MatCloud 的建模功能可以轻松的实现扩胞、切面、随机取代、建立吸附构型等操作。本例中，所需组件如下：
- 点击输入控制，将【通用导入组件】拖至右边的工作流设计页面，并导入表面结构；
- 点击建模，将组件【吸附建模(原子)】拖至右边的工作流设计页面并连接成计算流程，如下图所示：
图5 MatCloud 吸附建模工作流
3.设置高通量吸附建模参数并提交计算- 确定吸附原子类型：点选元素周期表中的原子类型；
- 点选确定吸附表面：上／下／双面；
- 手动设置基底到吸附物质的距离（吸附高度）；
- 吸附浓度：通过指定吸附物质的个数控制吸附浓度。
图6 MatCloud 吸附原子参数设置
高通量生成多个吸附位点
图7 MatCloud 高通量吸附位点的生成
4.查看计算结果
- 展示所有吸附位点的吸附模型，并支持多行展示结构。
图8 MatCloud 高通量吸附建模结果
5.吸附结构的复用
MatCloud 搭建的高通量吸附模型支持3种导出方式——“到数据库”“到结构集”“到本地”。导出的模型可支持后续的一系列高通量性质计算。
图9 MatCloud 高通量吸附模型导出方式
MatCloud 高通量吸附建模特点
云操作
建模功能组件化
拖拽式工作流
图形化高通量建模
自动筛选生成可能结构
支持手动筛选输出结构及导出方式
“0”机时完成建模
便捷的自动化高通量原子吸附建模操作，你学会了吗？
偷偷说一下，此功能组件目前可以免费使用，
如此实用的功能，大家还不赶紧用起来！
