加权回归的参数:Gaussian初级二---寻找势能面上的驻点
加权回归的参数:Gaussian初级二---寻找势能面上的驻点也可以使用Results菜单上的Optimization项查看优化中每一步的各种量的图。默认对总能和均方根梯度模制图。使用绘图窗口的Plot菜单上的Plot Molecular Property项创建额外的图表。可以用工具栏左边的绿色按钮开始动画,此外可以用模式下的弹出(右击)菜单控制各个子窗口的位置和尺寸。还可以用Display Format对话框(或者相应的偏好选项)的Molecule面板上的Animation Delay区域设置动画速度;值越大,动画越慢。当优化收敛的时候意味着优化过程的完成:收敛是指,当力接近零并且下一优化步骤的步长非常小的时候(下面是一些算法定义的预设值)。以下是高斯使用的具体收敛标准:检查优化结果在GaussView中,勾选Open File对话框底部的Read Intermediate Geometries选项。这将会导致文件中能找到的所有可用结构都被加载到同
几何结构优化是指寻找势能面上的极小值点,从而预测分子体系平衡结构的过程。优化也可用于寻找过渡态结构。优化寻找极小值点的过程也被叫做极小化。
高斯的几何结构优化从输入指定的分子结构开始进行,沿着势能面一步一步优化,在每一点计算能量和梯度。梯度表明从当前点开始沿着势能面能量下降最迅速的方向,以及该斜坡的陡度,此数据被用来决定下一步的方向和大小。
大部分优化算法也需要估计或计算能量关于分子坐标的二阶导数值,更新力常数矩阵(被称为Hessian)。这些力常数给出了势能面在那一点的曲率,这为下一步计算提供了额外的有用信息。
优化收敛标准
当优化收敛的时候意味着优化过程的完成:收敛是指,当力接近零并且下一优化步骤的步长非常小的时候(下面是一些算法定义的预设值)。以下是高斯使用的具体收敛标准:
- 力必须基本上是零。具体的说,力的最大成分必须低于界值(截断值)0.00045。
- 力的均方根(RMS)必须低于定义的公差0.0003。
- 计算的下一步最大位移必须小于定义的界值0.0018(也就是基本上为0)。最大位移是分子结构的所有坐标的最大改变量。
- 下一步位移的均方根必须低于它的界值0.0012。
检查优化结果
在GaussView中,勾选Open File对话框底部的Read Intermediate Geometries选项。这将会导致文件中能找到的所有可用结构都被加载到同一个分子组。
可以用工具栏左边的绿色按钮开始动画,此外可以用模式下的弹出(右击)菜单控制各个子窗口的位置和尺寸。还可以用Display Format对话框(或者相应的偏好选项)的Molecule面板上的Animation Delay区域设置动画速度;值越大,动画越慢。
也可以使用Results菜单上的Optimization项查看优化中每一步的各种量的图。默认对总能和均方根梯度模制图。使用绘图窗口的Plot菜单上的Plot Molecular Property项创建额外的图表。
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