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lncrna转录后调控图怎么理解(文献1详解⑤探索lncRNA分子机制)

lncrna转录后调控图怎么理解(文献1详解⑤探索lncRNA分子机制)3恢复性实验表明,恢复AXL 和 c-MET的表达可恢复lncARSR敲除的抗舒尼替尼肾癌癌细胞的表型和下游信号通路(见下图C,D,H,I),而且一起敲除AXL 和 c-MET可有效消除lncARSR介导的抗舒尼替尼特性,而单独敲除没有影响(E,F,J,K)。以上结果表明在高表达lncARSR与AXL 和 c-MET高表达在抗舒尼替尼过程中是同时发生的。作者用抗舒尼替尼细胞外泌体或电击导入lncARSR的外泌体孵育亲本细胞,发现AXL 和 c-MET的表达升高,而沉默lncARSR可消除这一效应(见下图E、F)。2

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导语:继作者发现了抗舒尼替尼关键lncARSR,并做了lncARSR的表达调控机制,功能研究,并进一步证明了lncARSR在临床上与舒尼替尼耐药性的相关性,发现其可作为临床指标后,上期作者证实了lncARSR可以被包装进外泌体中,从而在癌细胞间传导舒尼替尼耐药性。然后问题来了,高表达lncARSR可增强肾癌细胞舒尼替尼抗性的分子机制是什么?我们今天一起来探索一番!

lncARSR与RTKs

有证据显示受体酪氨酸激酶(RTKs)在舒尼替尼耐药性产生过程中发挥关键作用。因此作者抑制抗舒尼替尼肾癌细胞lncARSR的表达,WB鉴定多种RTKs的表达变化,发现AXL 和 c-MET的磷酸化水平、蛋白 和mRNA的表达均下降(见下图A、B)。

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以上结果表明在高表达lncARSR与AXL 和 c-MET高表达在抗舒尼替尼过程中是同时发生的。

作者用抗舒尼替尼细胞外泌体或电击导入lncARSR的外泌体孵育亲本细胞,发现AXL 和 c-MET的表达升高,而沉默lncARSR可消除这一效应(见下图E、F)。

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恢复性实验表明,恢复AXL 和 c-MET的表达可恢复lncARSR敲除的抗舒尼替尼肾癌癌细胞的表型和下游信号通路(见下图C,D,H,I),而且一起敲除AXL 和 c-MET可有效消除lncARSR介导的抗舒尼替尼特性,而单独敲除没有影响(E,F,J,K)。

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另外抑制AXL 和 c-MET的表达可使lncARSR过表达的亲本细胞恢复对舒尼替尼的敏感性并阻塞相关信号通路(见下图G,H,L)。

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综上所述,lncARSR是通过AXL 和 c-MET调节舒尼替尼耐药性的。

lncARSR与miRNA

根据已有报道定位细胞质lncRNA可能具有发挥内源性竞争RNA功能隔绝miRNA,导致与相应miRNA结合的mRNA释放。

为验证这一假设,作者首先敲除Dicer抑制miRNA的产生,而这导致了过表达lncARSR促进AXL 和 c-MET的表达这一效应被消除(见下图A),这说明miRNA在此过程中发挥关键作用。

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接着为了证明这一关键作用,作者采用AGO2-RIP实验方法鉴定过表达lncARSR的786-O 细胞中lncARSR与AGO2的结合升高,而与AXL 和 c-MET的mRNA结合降低。同时敲除lncARSR的7Su3rd细胞中AXL 和 c-MET与AGO2的结合升高(见下图A)。

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这些结果说明lncARSR与AXL 和 c-MET的mRNA竞争以AGO2为基础的miRNA诱导抑制复合物。

寻找参与其中的miRNA

生物信息学分析显示,lncARSR与AXL 和 c-MET的非编码区域均含有四个miR-34 和miR-449的共用miRNA反应元件(MREs)(见下图B)。而且发现在抗舒尼替尼细胞中存在足够的lncARSR 和 miR-34/449拷贝数(见下图C),这对ceRNA-miRNA相互作用非常重要。

MS2-RIP实验结果显示对比空白对照和突变组,从MS2bs-lncARSR获得的miR-34 /449明显要丰富(见下图B)预示着lncARSR 和 miR-34/449存在特异性的相互作用。

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验证miRNA

作者以psi-CHECK2-lncARSRmt(miR-34/449)为阴性对照,psiCHECK2-miR-34 3*为阳性对照,设计荧光报告基因系统,实验结果显示miR-34 或 miR-449 mimics可显著抑制psi-CHECK2-lncARSR(海肾荧光素酶基因3`端非编码区含有lncARSR)的荧光素酶活性而对psi-CHECK2-lncARSRmt(miR-34/449)的无影响(见下图C),说明miR-34 或 miR-449可主动结合到lncARSR上。

接着作者同样采用荧光报告基因系统,检测lncARSR对miR-34生物传感器的影响,又从反向证明lncARSR可主动与miR-34 或 miR-449(见下图D),这些结果说明lncARSR存在与miR-34 或 miR-449结合的功能性位点。

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而且功能验证实验结果显示:采用miR-34海绵抑制miR-34和 miR-449可又有效恢复由敲除LncARSR导致的舒尼替尼抗性的下降(见下图D-F),同时miR-34 mimic可消除lncARSR介导的舒尼替尼抗性(见下图G-I)。

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lncARSR与miRNA与RTKs

最后,作者探究lncARSR对miR-34和 miR-449的隔离效应是否会上调AXL 和 c-MET的表达。

荧光报告基因检测结果显示,miR-34海绵可恢复由lncARSR敲除造成的AXL 和 c-MET mRNA表达下调(见下图E),同时miR-34和 miR-449过表达可消除由lncARSR过表达造成的AXL 和 c-MET mRNA表达上升(见下图F)。

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这些结果在AXL 和 c-MET mRNA和蛋白水平做了进一步验证(见下图G、H、J、K)。

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以上结果说明lncARSR作为miR-34和 miR-449的分子海绵促进AXL 和 c-MET的表达。

来源:永诺生物

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