r语言中ggplot2如何修改图例内容(R可视化ggplot2包扩展包ggprism介绍)
r语言中ggplot2如何修改图例内容(R可视化ggplot2包扩展包ggprism介绍)
今天给大家介绍一个ggplot2包的扩展包——ggprism包,结合该包可绘制GraphPad prism风格样式图形,具体效果我们看图说话!
安装、加载包rm(list=ls())
# 安装包
install.packages("ggplot2")
install.packages("ggprism")
install.packages("tidyverse")
install.packages("ggpubr")
#加载包
library(ggplot2)
library(ggprism)
library(tidyverse)
library(ggpubr)
准备绘图数据
#自己随机编写的数据
df <- data.frame(
A_1 = c(2 5 6 5 4 8 6 3 8 9)
A_2 = c(5 8 6 3 4 7 9 3 6 4)
B_1 = c(15 10 5 18 12 13 16 14 10 9)
B_2 = c(25 20 23 15 14 24 20 22 25 26)
C_1 = c(1 3 6 5 2 3 6 2 4 1)
C_2 = c(7 8 9 6 7 8 9 6 7 10))
#使用tidyverse包对数据进行处理
df <- df %>%
gather(key = 'samples' value = 'values') #gather()函数可以把多列数据合并成一列数据
#添加分组信息
df$group = rep(c("A" "B" "C") each = 20)
head(df)#预览数据
1)ggplot2包绘制的简单图形
p1 <-ggplot(df aes(samples values color=samples fill=samples))
geom_bar(stat="summary" fun=mean position="dodge")
stat_summary(fun.data = 'mean_sd' geom = "errorbar" width = 0.3 color="black")
p1
2)通过ggprism包调整主题风格
#通过names()函数查看该包包含的主题
names(ggprism_data$themes)
#通过preview_theme()函数可预览每一个主题的样式
preview_theme("diazo")
preview_theme("candy_soft")
preview_theme("blueprint")
#我们可以通过theme_prism()函数对ggplot2的主题进行设置
p1 theme_prism(palette="summer")
#我们也可以通过ggprism自带调色板对ggplot2绘制图形颜色进行改变
p1 scale_fill_prism(palette = "summer")
#对主题及颜色同时设置
p1 theme_prism(palette="summer")
scale_fill_prism(palette = "summer")
#通过??theme_prism查看其中的参数,然后我们进行具体设置
??theme_prism
theme_prism(
palette = "black_and_white"
base_size = 14
base_family = "sans"
base_fontface = "bold"
base_line_size = base_size/14
base_rect_size = base_size/14
axis_text_angle = 0
border = FALSE)
#应用
p1 theme_prism(palette="summer"
base_fontface = "plain" # 字体样式
base_family = "serif" # 字体格式
base_size = 16 # 图形字体大小
base_line_size = 0.8 # 坐标轴粗细
axis_text_angle = 45) #角度
scale_fill_prism(palette = "summer")