seer数据库mac可以用吗(SEER里的那些特殊变量)
seer数据库mac可以用吗(SEER里的那些特殊变量)02③研究口腔舌癌的文章,纳入神经侵犯 perineural invasion先来安利几篇SEER数据库,含有这些“特殊变量”的文章① 研究直肠癌的文章,纳入了癌胚抗原CEA② 研究肝癌的文章,纳入甲胎蛋白 AFP
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经常收到朋友提问,SEER里面有基因数据吗?有肿瘤标志物吗?有免疫组化吗?
答案是有的,不过数量有限,而且不是很明显,新手确实不好找到。
如果能灵活应用,就可以为自己的研究增色不少
先来安利几篇SEER数据库,含有这些“特殊变量”的文章
① 研究直肠癌的文章,纳入了癌胚抗原CEA
② 研究肝癌的文章,纳入甲胎蛋白 AFP
③研究口腔舌癌的文章,纳入神经侵犯 perineural invasion
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SEER数据库的特殊变量在哪里?
就是我们下载数据的时候,出现的这些SSF1,SSF2。。。SSF20等变量
但是我们要知道分别代指什么
SSF:site specific factor
SEER Stat 软件里位置如下,直接下载即可
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SSF替换
参考 SSFs.Released.v205.Nov2016.xls
说明:并非每一种癌症都有可用SSF等指标
而且,同一种SSF在不同癌种里面,对应内容也不一样
比如SSF1,在乳腺癌里代表ER状态,在食管胃结合部癌,则代表区域淋巴结检查结果
通过该文件,能够得到SSF对应指标名称,但是对于后续数据整理,具体数值变换没有帮助
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这时候需要使用 CS_Coding_Instructions_V0205.exe 这一软件
比如这里,000代表未做检查,010代表ER( ),020代表ER(-)
做乳腺癌的同学,能够把ER PR HER2指标纳入进去,文章一定增色不少
文示例文献:
1.Tan Y Fu D Li D et al. Predictors and Risk Factors of Pathologic Complete Response Following Neoadjuvant Chemoradiotherapy for Rectal Cancer: A Population-Based Analysis. Front Oncol. 2019;9:497. Published 2019 Jun 13. doi:10.3389/fonc.2019.00497
2.Berger NG Tanious MN Hammad AY et al. External radiation or ablation for solitary hepatocellular carcinoma: A survival analysis of the SEER database. J Surg Oncol. 2017;116(3):307–312. doi:10.1002/jso.24661
3.Goodman M Liu L Ward K et al. Invasion characteristics of oral tongue cancer: frequency of reporting and effect on survival in a population-based study. Cancer. 2009;115(17):4010–4020. doi:10.1002/cncr.24459
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