染色体组的图解（免费基因染色体位置图绘制工具MG2C）

染色体组的图解（免费基因染色体位置图绘制工具MG2C）可以看出一共需要输入两个文件，其一是gene在染色体上的位置信息，其二是染色体的长度。准备这两个input可以从UCSC 数据库下载gtt文件，提取目标基因的位置信息和染色体的长度信息。准备工作MapGene2Chrom网址：http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.1/数据准备打开网页，右边的两个方框内是需要输入的数据：1.家族中基因的信息，从左到右依次为：基因的ID，基因的起始位置，基因的终止位置，该基因所在的染色体ID，最后一列是非必需的，可选择性设置该基因ID显示的颜色如black，blue等；2基因所在染色体的信息（注意：只需要输入1中所有基因所在的染色体ID并集，并不需要输入该物种所有的染色体信息），从左到右依次为：染色体ID，染色体序列的长度

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今天，小编给大家安利一个可在线绘制基因染色体位置图的工具—MapGene2Chrom简称MG2C。MapGene2Chrom相比Gbrowse、MapViewer等工具输入数据格式简单，输出结果易于修改，且图片格式为SVG矢量图，具有很好的移植性，最最重要的是不用注册、完全免费。

目前MapGene2Chrom已经由最初的v1.0版本更新为v2.1版本，下面小编就以最新的v2.1版本演示MapGene2Chrom的使用方法。

MapGene2Chrom网址：http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.1/

数据准备

打开网页，右边的两个方框内是需要输入的数据：1.家族中基因的信息，从左到右依次为：基因的ID，基因的起始位置，基因的终止位置，该基因所在的染色体ID，最后一列是非必需的，可选择性设置该基因ID显示的颜色如black，blue等；2基因所在染色体的信息（注意：只需要输入1中所有基因所在的染色体ID并集，并不需要输入该物种所有的染色体信息），从左到右依次为：染色体ID，染色体序列的长度

准备工作

可以看出一共需要输入两个文件，其一是gene在染色体上的位置信息，其二是染色体的长度。准备这两个input可以从UCSC 数据库下载gtt文件，提取目标基因的位置信息和染色体的长度信息。

UCSC：http： //genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway

输出结果展示

生成的图片是默认格式，若满足你的要求可右键点击图片下方保存SVG格式图片。

个性化设置

但许多时候我们还想来点不一样的设置，网页左边的parameters setting，包含针对染色体id字体颜色，SVG的尺寸等的设置。

注意事项

MapGene2Chrom的绘图速度较快，且操作简单。基因的染色体位置图表现形式简洁明，快动手试试吧！