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数值分析 数据挖掘(手把手教你如何用TCGA数据挖掘做差异mRNA分析)

数值分析 数据挖掘(手把手教你如何用TCGA数据挖掘做差异mRNA分析)文章目录进步的第一步就是敲下文中的代码今天我们主要讲TCGA数据挖掘-神经胶质瘤(GBM)差异mRNA分析,实操性非常强一千种方法练一次不如一种方法练一千次

15岁觉得游泳难,放弃游泳,到18岁遇到一个你喜欢的人约你去游泳,你只好说“我不会耶”。18岁觉得英文难,放弃英文,28岁出现一个很棒但要会英文的工作,你只好说“我不会耶”。人生前期越嫌麻烦,越懒得学,后来就越可能错过让你动心的人和事,错过新风景。

数值分析 数据挖掘(手把手教你如何用TCGA数据挖掘做差异mRNA分析)(1)

写在前面

之前有一篇文章关于TCGA数据的详细介绍带你玩转TCGA数据库

新来的小伙伴可以来参考一下

今天我们主要讲TCGA数据挖掘-神经胶质瘤(GBM)差异mRNA分析,实操性非常强

一千种方法练一次

不如一种方法练一千次

进步的第一步就是敲下文中的代码

文章目录

1.TCGA-GBM数据下载

  • 2.提取mRNA数据
  • 3.ID转换,ensemblID转换为symbolID
  • 4.数据整理
  • 5.PCA
  • 6.差异表达
  • 7.富集分析

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1.TCGA-GBM数据下载

数值分析 数据挖掘(手把手教你如何用TCGA数据挖掘做差异mRNA分析)(3)

2.提取mRNA数据

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3.ID转换,ensemblID转换为symbolID

数值分析 数据挖掘(手把手教你如何用TCGA数据挖掘做差异mRNA分析)(5)

4.数据整理

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5.PCA

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数值分析 数据挖掘(手把手教你如何用TCGA数据挖掘做差异mRNA分析)(9)

6.差异表达

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