口袋妖怪里冷门但是厉害（无数人心中神作水晶）
口袋妖怪里冷门但是厉害（无数人心中神作水晶）设计变化新增非玩家角色米那君，一位谜样的少年，以捕获水君为自己的目标。和《金／银》的不同新角色新增性别为女孩子的主角，克丽丝。这是第一个玩家可以选择女孩子为主角的版本。
精灵宝可梦 水晶版
（日文︰ポケットモンスター クリスタルバージョン，英文︰Pokémon Crystal Version）是《精灵宝可梦》系列游戏的第七个作品*。它是《金／银》发售后一年所推出的资料片，其冒险地区与《金／银》相同，是城都地区，并且在成为登入名人堂后可以前往关都地区冒险。
2017年12月14日，The Pokémon Company与任天堂在其官方网站、YouTube频道及各大社群网站宣布即将在2018年1月26日，于任天堂3DS上的Virtual Console发行《精灵宝可梦 水晶版》，与已经在Virtual Console发行的《红／绿／蓝》、《皮卡丘》和《金／银》相同，在3DS上的《水晶版》和《金／银》将可以互相进行无线通讯交换、对战及透过宝可梦虚拟传送上传本游戏中的宝可梦至宝可梦虚拟银行，除此之外，亦支援“时光胶囊”，能将Virtual Console版本的《红／绿／蓝》和《皮卡丘》中的宝可梦上传至本版本中，此外，与GBC上的《水晶版》不同，3DS VC版本的游戏中不需要使用额外的配件，即可与幻之宝可梦时拉比相遇。
再发行版本外包装
和《金／银》的不同
新角色
新增性别为女孩子的主角，克丽丝。这是第一个玩家可以选择女孩子为主角的版本。
新增非玩家角色米那君，一位谜样的少年，以捕获水君为自己的目标。
设计变化
首次添加了宝可梦的登场动画，这个设计曾一度被废除，直到《绿宝石》才再度采用。
新增进入不同地图时，游戏中会显示该地图名称的功能。
宝可梦联盟中渡的房间重新设计，可以看见迷你龙的雕像。
雷公、水君和炎帝的战斗拥有特殊的战斗音乐。《水晶版》也是第一个与传说的宝可梦对战会出现不同的战斗音乐的版本。
龙穴的龙圣祠开放，圣祠后院添加了四棵头锤树。
部份宝可梦的图像重新设计。
身体构造的调整，如黑鲁加和蓝鳄。
颜色的修正，使其更贴近官方绘图，如：小磁怪、圆丝蛛、狃拉和水君…等等。
部份训练家的台词和站立的位置变更。
地点变化
桔梗市西边新增了一片草地。
新增阿露福遗迹的石室，增加了未知图腾的出现率。
擂钵山的部分内部地图结构重新设计。
新增满金百货大楼的屋顶观景台。
冰雪通路更改成被冰覆盖的地图效果，并更改部分迷宫行走路径。
烧焦塔的外观与内部地图结构重新设计。
狃拉可以在冰雪通路遇见。在《金／银》中，只有白银山才能遇见。
鸭嘴火兽不再出现在烧焦塔，而是出现在白银山。
关都地区的野生宝可梦分布稍许改动。
游戏变化
洛奇亚和凤王均以60级出现在游戏中。直到玩家捕获了炎帝、水君、雷公才可以捕获凤王。
玩家可以在《水晶版》中获得更多种类的宝可梦。例如，天蝎和盔甲鸟都是只在《金／银》的其中一个版本里出现，但在《水晶版》中它们都可以被捕获。
在《金／银》中，几乎所有训练家打电话给主角时说的台词都一模一样。而在《水晶版》中他们的台词得到了更多的丰富（谈论时会提及购物亦或是打扮之类的等等），并且会为了对战之外的事打电话给玩家，譬如要送给主角道具或告诉玩家稀有宝可梦大量出现的情报。
和水君有关的剧情更为丰富，主角会在游戏过程中多次遇到水君。玩家要在铃铛塔使用透明铃铛才能与水君对战，并且它不会逃跑。
新增广播节目葵妍的密语，主角可以回答问题收集点数兑换奖品。
获得升龙徽章需要主角需要前往龙穴中的龙圣祠接受小椿的爷爷以及龙使者一族的长老们的考验。无论玩家有没有通过考验，小椿都会拒绝颁发徽章，直到她爷爷威胁她要告诉渡她才愿意把徽章颁给玩家。如果主角通过了考验，小椿的爷爷还会送给主角学会神速的迷你龙。
日文版的《水晶版》中，手动重设时钟的功能被取消。
可以一次交付钢铁多个同一颜色的球果以同时制作复数个精灵球。
在日文《水晶版》中，如果玩家将在满金市的宝可梦中心获得的蛋兑换券交给培育屋夫妇，他们会送给玩家不可思议的蛋，这颗蛋有可能孵化出皮丘、皮宝宝、宝宝丁、无畏小子、迷唇娃、电击怪或鸭嘴宝宝，并且有50%的可能性孵化出异色；在英文版《水晶版》中，培育屋夫妇会直接送给玩家不可思议的蛋，这颗蛋有14%的可能性孵化出异色。
《水晶版》无法获得的宝可梦
地区版本差异
由于移动适配器GB的存在，日文《水晶版》的很多设定与海外版完全不同，并且随着移动系统GB的关闭，很多内容在之后的重制版《心金／魂银》中也没有出现：
在日文版中，时拉比可以通过移动适配器GB获得的ＧＳ球事件来捕捉，而在海外版中，这些数据仍然在游戏中且已经翻译为了对应语言，但是事件却被取消了。
在日文版中，满金市的宝可梦中心被替换成宝可梦对话中心，而海外版中这里依然是宝可梦中心，
在日文版中，可以宝可梦对话中心的交易柜台使用移动适配器GB与其他玩家交换宝可梦，如同之后的GTS，同时可以在这里交换宝可梦的蛋兑换券。在新闻机器可以看到全日本上传存档数据的玩家的冒险进度，但海外版无法使用此服务。
在日文版中奇怪的蛋由于需要宝可梦的蛋兑换券兑换才能获得，因此有50%的几率是异色的，而在海外版中可以直接获得奇怪的蛋，因此只有14%的几率是异色。
对战塔在日文版中需要连接移动适配器GB才可进入，而在海外版则可以直接进入。
音乐
主页面：任天堂DS 精灵宝可梦 心金＆魂银 音乐完全收录
《金／银》及《水晶版》没有独立发售原声碟，直至推出《心金／魂银》才一拼收录。
电池寿命
《水晶版》包装内的电池寿命提示
与大多数任天堂Game Boy和任天堂Game Boy Color游戏相同，第二世代游戏使用SRAM（静态随机存取记忆体）保存记录，需要保证游戏卡内的电池（CR2025纽扣型焊脚电池）有足够的电压，而由于时间系统的存在导致其持续耗费电力，官方附带说明提示游戏电池的寿命仅为启动后2年，但部分游戏卡的电池达到了5年以上的寿命。
在电池即将耗尽时，时钟的运转会变得不正常，电池耗尽后游戏虽然可以正常运行并可在运行时存储记录，但断电后记录就会丢失，更换电池需要将焊脚电池拆卸并将新电池重新焊接（有部分玩家采用切割掉原有电池后在引脚上用胶贴粘接新电池，或者直接加装电池座的方法，但存在风险，而且容易造成接触不良而清除记录），并且在更换电池时，记录会被消去，如需保留记录，只能在加电的状态下更换电池，或者在更换前使用第三方的设备提取备份记录。
兼容性与联动
GAME BOY ADVANCE
《金／银》、《水晶版》支持在Game Boy Advance上兼容运行，效果与任天堂Game Boy Color相同。
与第一世代联动
第一世代与第二世代联动的方式为时光胶囊，且可以互传宝可梦。
宝可梦在第二世代学习到第二世代新增的招式时，将不能传到第一世代游戏。
但是由于两个世代有些许差异，可能会造成一些错误。
传输错误
与计步器联动
《金／银》、《水晶版》可以利用Game Boy Color上的红外线接口与宝可梦计步器（旧版）进行联动。
心金魂银的宝可计步器与宝可梦计步器（旧版）相似，但是旧版宝可梦计步器只能使用皮卡丘，且带有彩色屏幕。
互传神秘礼物
2台任天堂Game Boy Color上运行《金／银》、《水晶版》可以利用红外线接口互传神秘礼物。可以得到一些主角卧室的家具。
与移动电话联动
日版《水晶版》可以利用移动适配器GB接驳支持移动系统GB功能的移动电话，通过移动通信网络进行联网，在对战塔进行对战。且可以获得一些稀有道具。
满金市的宝可梦中心被扩大，同样也可以使用这个功能。
由于停止服务，现已不能使用。
由于服务仅限于日本，所以海外版《水晶版》可以直接进入对战塔，满金市宝可梦中心也是正常大小。
与Game Boy打印机联动
可以使用Game Boy打印机外设，利用热敏纸打印未知图腾图案、盒子内容、图鉴、证书等。
与竞技场联动
竞技场金银可以通过N64的64GB转换器，将《金／银》、《水晶版》游戏卡插入外设内，读取游戏卡内容。
而可以在2个手柄上插入2张《金／银》《水晶版》游戏卡进行对战，也可以获得会冲浪的皮卡丘。
再发行版变更
3DS的X键与第四世代后游戏一样可以打开菜单（等同于START键），Y键则等同于SELECT键。
支持无线联机功能，可以利用本地无线连接与其他再发行版交换或对战，也可以使用时间胶囊。
能够与宝可梦虚拟银行联动，把宝可梦传输到《太阳／月亮》。
无法与竞技场金银联动。
ＧＳ球及时拉比事件改为在登入名人堂后触发。
不能使用移动适配器GB的任何功能。
细节
《水晶版》是目前唯一一个日文标题带有“バージョン”的版本。
早期版本的日文标题曾经设计的类似《金／银》混合后来的《心金／魂银》，加入了水晶的元素，而且也没有バージョン字样。
本作是唯一一个以种族值580的传说的宝可梦作为封面的主系列游戏。
本作是唯一一个搭载日本本土限定技术（移动系统GB）的主系列游戏，以至于日本限定服务结束后，游戏内很多地图和内容都被废弃。
虽然在再发行版内官方通过更改获取ＧＳ球的方法来让玩家可以获取时拉比，但是其他依赖移动系统GB的功能依然无法使用。
本作是第一个出现女主角的精灵宝可梦主系列游戏。
虽然《水晶版》是任天堂Game Boy Color游戏，但是发售时临近GBA发售，因此在日本反而发行了水晶限定版GBA，而在海外由于游戏发售时GBA已经发行，还推出了同捆GBA的版本。
《水晶版》游戏卡采用冰蓝色带有亮粉的透明外壳，日文版电路板还加入了白色覆膜和水君的头冠的图样（也是《水晶版》的图标），同时游戏卡右上角取消了缺角，这是由于《水晶版》是任天堂Game Boy Color后期的任天堂Game Boy Color专用游戏，而当时任天堂Game Boy Color专用游戏卡都采用彩色透明塑胶、游戏卡上部凸起的设计以与之前的共通游戏区分，取消缺角则让《水晶版》的游戏卡插入带有限位装置的任天堂Game Boy后无法启动游戏机。
虽然游戏卡没有缺角，但是仍然可以在任天堂Game Boy Pocket、任天堂Game Boy Light、Super Game Boy和Super Game Boy 2这几种没有开关限位设计的设备上启动，不过启动后游戏会提示无法运行。
海外《水晶版》也可以在标题画面重设时间，不过操作更加复杂。
在标题画面同时按下下方向键、SELECT键和B键。
按住SELECT键不放，并松开下方向键和B键。
仍然按住SELECT键不放，并同时按下左方向键和上方向键。
松开SELECT键，然后松开左方向键和上方向键。
之后需要输入根据名字与零花钱计算得到的密码来进行重设。
