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遗传和变异知识网络图(Nature科学家绘制出14万人的遗传变异图谱)

遗传和变异知识网络图(Nature科学家绘制出14万人的遗传变异图谱)相关论文:但是,预测的功能丧失变体会因注解错误而变得更加丰富,并且往往在极低的频率下被发现,因此要进行分析,需要仔细的变体注解和非常大的样本量。在筛选出由测序和注释错误引起的假象后,研究人员在该队列中确定了443 769个高可信度预测的功能丧失变异。使用改良的人类突变率模型,研究人员根据代表灭活耐受性分布对人类蛋白质编码基因进行分类,使用来自模式生物和工程化人类细胞的数据验证该分类,并证明其可用于提高常见和罕见疾病的基因发现。据介绍,使蛋白质编码基因失活的遗传变体是有关基因破坏表型后果的来源。其中,对生物体功能至关重要的基因将在自然种群中被耗尽,而非必需基因将耐受它们积累。

作者丨小柯

遗传和变异知识网络图(Nature科学家绘制出14万人的遗传变异图谱)(1)

美国麻省总医院Konrad J. Karczewski、Daniel G. MacArthur等研究人员合作绘制了14万人的遗传变异图谱。

这一研究成果于2020年5月27日在线发表在《自然》上。

研究人员将来自人类测序研究的125 748个外显子组和15 708个基因组合并描述到 Genome Aggregation Database(gnomAD)中。

遗传和变异知识网络图(Nature科学家绘制出14万人的遗传变异图谱)(2)

在筛选出由测序和注释错误引起的假象后,研究人员在该队列中确定了443 769个高可信度预测的功能丧失变异。

使用改良的人类突变率模型,研究人员根据代表灭活耐受性分布对人类蛋白质编码基因进行分类,使用来自模式生物和工程化人类细胞的数据验证该分类,并证明其可用于提高常见和罕见疾病的基因发现。

据介绍,使蛋白质编码基因失活的遗传变体是有关基因破坏表型后果的来源。其中,对生物体功能至关重要的基因将在自然种群中被耗尽,而非必需基因将耐受它们积累。

但是,预测的功能丧失变体会因注解错误而变得更加丰富,并且往往在极低的频率下被发现,因此要进行分析,需要仔细的变体注解和非常大的样本量。

相关论文:

https://www.nature.com/articles/s41586-020-2308-7

小柯报道:

http://news.sciencenet.cn/htmlpaper/2020/5/202053014153755756711.shtm

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