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斯坦福大学tensorflow与深度学习(DeepMind加持的GNN框架正式开源)

斯坦福大学tensorflow与深度学习(DeepMind加持的GNN框架正式开源)图模拟不同类型数据之间的关系:网页(左)、社交联系(中)或分子(右)经过几十年的基础研究,GNN已经在很多的领域都取得了进展,如流量预测、谣言和假新闻检测、疾病传播建模、物理模拟以及理解分子为什么有气味。而在现实世界和工程系统中,图无处不在。比如,一组物体、地点或人以及它们之间的联系通常可以用图形来描述。通常,在机器学习问题中看到的数据是结构化的或关系型的,因此也可以用图来描述。

编辑:好困 小咸鱼

【新智元导读】谷歌在垃圾邮件检测、流量估计以及YouTube内容标签等环境中使用了一种强大的工具GNN(图神经网络)。11月18日,谷歌联合DeepMind对外开源TensorFlow GNN工具,助力流量预测、谣言和假新闻检测、疾病传播建模、物理模拟等领域的基础研究。

11月18日,谷歌联合DeepMind发布了TensorFlow GNN(图神经网络)。

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目前,谷歌已经在诸如垃圾邮件检测、流量估计以及YouTube内容标签等环境中用上了这个库的早期版本。

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为什么要用GNN?

图(Graph)是用于表示对象之间关联关系的一种抽象数据结构,使用节点/顶点(Node/Vertex)和边(Edge)进行描述:顶点表示对象,边表示对象之间的关系。

而在现实世界和工程系统中,图无处不在。

比如,一组物体、地点或人以及它们之间的联系通常可以用图形来描述。

通常,在机器学习问题中看到的数据是结构化的或关系型的,因此也可以用图来描述。

经过几十年的基础研究,GNN已经在很多的领域都取得了进展,如流量预测、谣言和假新闻检测、疾病传播建模、物理模拟以及理解分子为什么有气味。

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图模拟不同类型数据之间的关系:网页(左)、社交联系(中)或分子(右)

通过GNN,就可以回答那些关于图的多种特征的问题。比如在图中观察到的各种不同的「形状」:图中的圆圈,可能代表子分子,也可能代表密切的社会关系。

在节点级的任务中,GNN可以对图的节点进行分类,并预测图中的分区和亲和力,类似于图像分类或分割。

在边级别的任务中,可以使用GNN来发现实体之间的连接,比如用GNN「修剪」图中的边,从而识别场景中对象的状态。

TF-GNN的结构

TF-GNN为在TensorFlow中实现GNN模型提供了构建模块。

除了建模API之外,TF-GNN还围绕着处理图数据的困难任务提供了大量的工具:基于Tensor的图数据结构,数据处理管道,以及一些供用户快速上手的示例模型。

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组成工作流程的TF-GNN的各个部分

TF-GNN库的初始版本包含了许多实用程序和功能,包括:

  • 一个高水平的Keras风格的API,用于创建GNN模型,可以很容易地与其他类型的模型组合。GNN经常与排名、深度检索(双编码器)或与其他类型的模型(图像、文本等)结合使用。
  • 用于异构图的GNN API。在现实世界中处理的许多图问题都包含不同类型的节点和边。因此,谷歌选择提供一种简单的方法来建模。
  • 一个定义明确的模式来声明一个图的拓扑结构,以及验证它的工具。这个模式描述了其训练数据的形状,并用于指导其他工具。
  • 一个保存了图数据的GraphTensor复合张量类型。其可以被分批处理,并有可用的图操作程序。
  • 一个对GraphTensor结构的操作库:
    • 在节点和边上进行各种有效的传播和池化操作的相关工具。
    • 一个标准的卷积库,可以被ML工程师/研究人员轻松扩展。
    • 一个高层次的API,供产品工程师快速建立GNN模型,而不必担心其细节问题。
  • 对磁盘上的图训练数据进行编码,以及用于将这些数据解析为数据结构的库。其中,模型可以从中提取各种特征。

使用示例

比如,使用TF-GNN Keras API建立一个模型,并根据用户观看的内容和喜欢的类型向其推荐电影。

通过使用ConvGNNBuilder方法来指定边缘和节点配置的类型,即对边缘使用WeightedSumConvolution。每次通过GNN时,都将通过Dense互连层来更新节点值:

import TensorFlow as tf import tensorflow_gnn as tfgnn # Model hyper-parameters: h_dims = {'user': 256 'movie': 64 'genre': 128} # Model builder initialization: gnn = tfgnn.keras.ConvGNNBuilder( lambda edge_set_name: WeightedSumConvolution() lambda node_set_name: tfgnn.keras.layers.NextStateFromConcat( tf.keras.layers.Dense(h_dims[node_set_name])) ) # Two rounds of message passing to target node sets: model = tf.keras.models.Sequential([ gnn.Convolve({'genre'}) # sends messages from movie to genre gnn.Convolve({'user'}) # sends messages from movie and genre to users tfgnn.keras.layers.Readout(node_set_name="user") tf.keras.layers.Dense(1) ])

此外,还可以在某些场景下让GNN使用一个更强大的自定义模型架构。

例如,指定某些电影或流派在推荐时拥有更多的权重。

那么,就可以通过自定义图卷积来生成一个更高级的GNN。

在下面的这段代码中,就用WeightedSumConvolution类来汇集边的值,并作为所有边的权重之和:

class WeightedSumConvolution(tf.keras.layers.Layer): """Weighted sum of source nodes states.""" def call(self graph: tfgnn.GraphTensor edge_set_name: tfgnn.EdgeSetName) -> tfgnn.Field: messages = tfgnn.broadcast_node_to_edges( graph edge_set_name tfgnn.SOURCE feature_name=tfgnn.DEFAULT_STATE_NAME) weights = graph.edge_sets[edge_set_name]['weight'] weighted_messages = tf.expand_dims(weights -1) * messages pooled_messages = tfgnn.pool_edges_to_node( graph edge_set_name tfgnn.TARGET reduce_type='sum' feature_value=weighted_messages) return pooled_messages

尽管卷积是在只考虑源节点和目标节点的情况下编写的,但是TF-GNN确保了它的适用性,并且可以无缝地在异构图(具有各种类型的节点和边)上工作。

安装说明

这是目前安装tensorflow_gnn预览版的唯一方法。强烈建议使用虚拟环境。

  1. 克隆tensorflow_gnn

$> git clone github/tensorflow/gnn.git tensorflow_gnn

  1. 安装TensorFlow

TF-GNN需要用到TensorFlow 2.7中的一个功能:tf.ExtensionTypes。

$> pip install tensorflow

  1. 安装Bazel

构建TF-GNN的源代码需要用到Bazel。

  1. 安装GraphViz

TF-GNN将使用GraphViz作为可视化工具。安装方法因操作系统而异,例如,在Ubuntu中:

$> sudo apt-get install graphviz graphviz-dev

  1. 安装tensorflow_gnn

$> cd tensorflow_gnn && python3 -m pip install

参考资料:

blog.tensorflow/2021/11/introducing-tensorflow-gnn.html?m=1

github/tensorflow/gnn

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