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高中生物必修二dna复制的特点:高中生物选修1教材答案-13

高中生物必修二dna复制的特点:高中生物选修1教材答案-13大豆蛋白胨5.0 g 胰胨5.0 g 酵母提取物10 g1.双歧杆菌的培养。本实验用双歧杆菌作为实验材料,需要在实验前一天培养双歧杆菌。双歧杆菌的培养基配方如下。2.DNA的合成方向;3.Taq DNA聚合酶的应用。(二)PCR的反应过程:知识要点:PCR的基本步骤及每个步骤所发生的变化。PCR扩增双歧杆菌编码16SrRNA的DNA片段

高中生物必修二dna复制的特点:高中生物选修1教材答案-13(1)

课题目标

本课题通过尝试PCR(DNA多聚酶链式反应)技术的基本操作,使学生体验PCR这一常规的分子生物学实验方法,理解PCR的原理,讨论PCR的应用。

课题重点与难点

课题重点:PCR的原理和PCR的基本操作。课题难点:PCR的原理。

高中生物必修二dna复制的特点:高中生物选修1教材答案-13(2)

课题背景分析

课题背景首先介绍了PCR是一种在体外迅速扩增DNA片段的技术,然后说明这一技术在遗传疾病的诊断、刑侦破案、古生物学、基因克隆等方面都有着广泛的应用,最后指出本课题的目标是了解PCR技术的基本原理,并尝试用PCR技术扩增DNA片段。

基础知识分析

(一)PCR原理知识要点:1.细胞内参与DNA复制的各种组成成分与反应条件;

2.DNA的合成方向;3.Taq DNA聚合酶的应用。

(二)PCR的反应过程知识要点:PCR的基本步骤及每个步骤所发生的变化。

实验案例

PCR扩增双歧杆菌编码16SrRNA的DNA片段

1.双歧杆菌的培养。本实验用双歧杆菌作为实验材料,需要在实验前一天培养双歧杆菌。双歧杆菌的培养基配方如下。

大豆蛋白胨5.0 g 胰胨5.0 g 酵母提取物10 g

葡萄糖10 g 微量盐溶液40 mL 半胱氨酸盐酸盐0.5 g

0.1%(0.1 g/100 mL)刃天青 1 mL

将上述物质溶解后,用蒸馏水定容至1 000 mL,调节pH至7.0。

其中,微量盐溶液的配方如下。

CaCl2 0.2 g MgSO4·7H2O 0.48 g K2HPO4 1 g KH2PO4 1 g NaHCO3 10 g NaCl 2 g

培养双歧杆菌24 h后,将菌液进行离心,双歧杆菌将沉淀在试管底部。

2.PCR操作。往双歧杆菌的沉淀中加入0.2 mL裂解液(裂解液配方为50 mmol/ L 的Tris-HCl 0.5 %的Tween 20 1 mg/ mL的蛋白酶K,pH为8.0),使细胞裂解,释放出DNA。将裂解液在55 ℃温度下加热孵育3 h后,再在95 ℃温度下加热10 min,然后立即放入冰水中冷却。冷却后离心,将10 μL上清液转移到0.5 mL的离心管中,然后依次加入10倍浓缩的扩增缓冲液5 μL、25 mmol/ L 的MgCl2溶液3 μL,20 mmol/L的4种脱氧核苷酸的等量混合液1 μL,Taq DNA聚合酶1 μL(2U/μL),蒸馏水29 μL,两种引物(25 μmol/ L) 各0.5 μL。混匀后按教科书表格中的数据设定PCR程序,进行反应。

需要说明的是,进行本实验可以直接购买试剂盒,试剂盒的价格比单独购买试剂的价格要低,并且包括了PCR所需的所有试剂。但是,试剂盒上往往只标出了试剂号,而没有标明试剂的名称,因此购买时要进行详细的咨询。如果单独购买试剂,PCR所需的引物必须委托相关的试剂公司来合成,合成后必须低温保存,否则引物容易发生降解。本实验所用引物的碱基序列如下。

引物I 5′GGATTCTGGCTCAGGATGAACGG 3′

引物II 5′CCGGGTGCTICCCACTTTCATGG 3′( I 代表碱基次黄嘌呤 它可以与A、G、C、T中的任何1个碱基配对)。

3.PCR产物的检测。产物的检测除了可以采用教科书中提供的方法外,还可以采用琼脂糖凝胶电泳的方法。琼脂糖凝胶电泳的有关介绍可参见本专题中课题3《血红蛋白的提取和分离》以及本课题的参考资料,具体操作步骤如下。

(1)用蒸馏水将电泳槽和梳子冲洗干净,放在水平桌面上,并架好梳子。

(2)配制浓度为1%(1 g/100 mL)的琼脂糖凝胶。在锥形瓶中,称取一定量的琼脂糖粉,加入适量蒸馏水,在微波炉内加热,使琼脂糖粉熔化,然后冷却至60 ℃,倒入电泳槽中,待其凝固。

(3)配制0.5倍的TBE电泳缓冲液100 mL。配制方法见本课题的参考资料部分。

(4)向电泳槽中缓缓倒入配制好的电泳缓冲液,以没过胶面2 mm为宜。小心移去梳子,注意不要破坏加样孔。如果样品孔内有气泡,应设法除去。

(5)在DNA样品中加入相当于样品0.2倍体积的载样缓冲液(载样缓冲液的成分参见本课题中参考资料),混匀后,加入样品孔内。

(6)接通电源。一般红色代表正极,黑色代表负极。DNA样品是由负极向正极移动,因此要保证靠近加样孔一端的电极为负极。电压为1~50 V/cm(长度以两个电极之间的距离计算)。

(7)当指示剂移动到凝胶边缘时,断开电源,终止电泳。一般200~400个核苷酸长度的PCR产物,在50 V电压下,电泳20~40 min即可。

(8)将凝胶放入溴化乙锭溶液中染色后,在紫外仪上观察电泳带及其位置,判断扩增产物的情况。

课题成果评价

DNA片段的扩增是否成功

检测DNA片段的扩增情况,既可以采用教科书中提供的方法,也可以采用教师用书中实验案例提供的方法。对于教科书中的方法,可以通过计算DNA含量来评价扩增的效果;对于电泳检测的方法,可以通过在紫外线下直接观察DNA带的分布及粗细程度来评价扩增的效果。如果扩增不成功,则要分析失败原因。可能的原因有:漏加了PCR的反应成分,各反应成分的用量不当,PCR程序设置不当等。

答案和提示

练习

1.提示:绘图可参考教科书中图5-9。PCR反应中的目的片段一般以2n的方式积累,其中n为反应循环次数。一个DNA片段在30次循环后反应物中大约有10亿个这样的片段(2n=230=1 073 741 824)。

2.提示:PCR引物是根据需要扩增的目标DNA的碱基序列来设计的。引物的设计需要丰富的分子生物学实验经验,感兴趣的学生可以参考《分子克隆实验指南》(见本专题参考书目),书中有详尽的论述。

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