高分辨率dna图谱,带你了解ctDNA的生物学特征
高分辨率dna图谱,带你了解ctDNA的生物学特征5手术后,ctDNA基本消失。3外周血游离DNA的大小约为160bp~190bp,其长度大约为50nm,相当于头发丝直径的千分之一。4
今天,小编本想科普一下ctDNA(circulating tumer DNA),但发现纯科普只要100字就可以讲完,所以本着科研应有的基本素养,咱们摆事实讲道理,尽量通俗易懂的和大家谈一谈。
ctDNA是血液中肿瘤细胞的游离片段,肿瘤细胞在增殖时产生的很多突变,都会在ctDNA中得到体现。通过对ctDNA的分析,我们可以得到很多关于肿瘤的信息,这些信息可以识别肿瘤的突变类型、判断肿瘤的发展期和复发转移的可能性等等。
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ctDNA可以通过多种方式进入血液中,比如:分泌、吞噬作用以及坏死。
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外周血游离DNA的大小约为160bp~190bp,其长度大约为50nm,相当于头发丝直径的千分之一。
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手术后,ctDNA基本消失。
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检测出的ctDNA,大部分是低频突变,MAF低于0.4%。
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在14种转移性肿瘤共136例样本中,ctDNA的含量具有很大差异。
Guardant Health 在2016年ASCO发布的数据,其统计了15种转移性肿瘤的5240个病例,从中可以看出不同癌种之间其ctDNA检出率具有一定的变化,但是总体而言,检出率很高,可以作为肿瘤转移的标志。
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CTC与ctDNA在点突变检测方面相比较,ctDNA检测灵敏度更高。
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2年存活率和ctDNA含量的关系如图所示:统计120例转移性结直肠癌病例,ctDNA突变的含量越高,存活率就越低。
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通过ctDNA分析,可以溯源肿瘤的位置。
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检测cfDNA全基因组甲基化,可以得到各组织或器官对cfDNA的贡献量。
小结
通过这10幅图,可以了解ctDNA的概念、来源、含量变化、检测方式和用途,但其功能远不止于此,对ctDNA的分析可以得到更多信息。下一期【图解】将进一步对ctDNA的应用场景及案例进行介绍。